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La NADH deshidrogenasa de tipo II

Una enzima respiratoria que las bacterias necesitan y nosotros no, y por eso una posible diana para antibióticos.

El dímero de NDH-2 (naranja pálido y dorado) con FAD (ciruela) y NAD (rosa) unidos en cada subunidad.

La NADH deshidrogenasa de tipo II (NDH-2) introduce electrones en la cadena respiratoria de muchas bacterias, incluidos patógenos, pero los humanos y los demás mamíferos no la tienen. Eso la convierte en una diana prometedora para nuevos antibióticos. Con los grupos de Greg Cook y Yoshio Nakatani en Nueva Zelanda y el de Judy Hirst en Cambridge, las estructuras de Caldalkalibacillus thermarum, junto con cinética y mutagénesis, mostraron que la enzima trata sus dos sustratos en sitios separados, lo que resolvió años de resultados contradictorios sobre cómo funciona (artículo).

Los cristales eran pequeños, difractaban débilmente y sufrían daño por radiación. Conseguir un conjunto de datos aprovechable supuso tomar datos con un haz de microfoco de decenas de cristales y escoger las mejores cuñas de datos para combinarlas.

Entrada PDB
5KMR en PDBe (también en RCSB PDB)
Liberada
2017-01-25
Resolución
3 Å
Artículo
The mechanism of catalysis by type-II NADH:quinone oxidoreductases. (Sci Rep, 2017)
Más
Detalles técnicos, enlaces y densidad electrónica

Imágenes y vídeo renderizados con UCSF ChimeraX; la vista en 3D es PDBe Mol*.

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