La NADH deidrogenasi di tipo II
Un enzima respiratorio che serve ai batteri ma non a noi, e quindi un possibile bersaglio per gli antibiotici.
La NADH deidrogenasi di tipo II (NDH-2) immette elettroni nella catena respiratoria di molti batteri, patogeni compresi, ma l’uomo e gli altri mammiferi non ce l’hanno. Questo ne fa un bersaglio promettente per nuovi antibiotici. Insieme ai gruppi di Greg Cook e Yoshio Nakatani in Nuova Zelanda e a quello di Judy Hirst a Cambridge, le strutture di Caldalkalibacillus thermarum, insieme a cinetica e mutagenesi, hanno mostrato che l’enzima gestisce i suoi due substrati in siti separati, chiudendo anni di risultati contrastanti su come funziona (articolo).
I cristalli erano piccoli, diffrangevano poco e soffrivano di danno da radiazione. Per ottenere un set di dati utilizzabile abbiamo dovuto raccogliere con un fascio microfocus da decine di cristalli e scegliere i settori di dati migliori da unire.
- Codice PDB
- 5KMR su PDBe (anche su RCSB PDB)
- Pubblicata
- 2017-01-25
- Risoluzione
- 3 Å
- Articolo
- The mechanism of catalysis by type-II NADH:quinone oxidoreductases. (Sci Rep, 2017)
- Altro
- Dettagli tecnici, link e densità elettronica
Immagini e video realizzati con UCSF ChimeraX; la vista in 3D è PDBe Mol*.