Ritratto di David Aragão

Scienziato senior di linea di luce, Diamond Light Source

David Aragão

Cristallografo delle proteine e scienziato di strumento, sempre alla ricerca dei dati migliori possibili. Amo il codice e Linux, e mi piace aiutare le persone a crescere.

Sono scienziato senior di linea di luce a Diamond Light Source, il sincrotrone del Regno Unito, un papà orgoglioso e zio di tutta una nuova generazione di nipoti. Ho passato quasi tutta la mia vita lavorativa tra raggi X e cristalli di proteine. Dal 2011 lavoro sulle linee di luce invece che come ricercatore a tempo pieno: mi occupo di tutta la catena che trasforma un cristallo in buoni dati, dall'hardware e l'elettronica al codice e ai sistemi Linux che li comandano, fino alle persone che li usano, dagli scienziati che vengono a misurare ai colleghi che formo. Niente mi piace quanto un bel rompicapo, soprattutto quando a guadagnarci è la scienza di qualcun altro.

L'ossidasi caa3 e il percorso dei suoi elettroni
La struttura del giornoL'ossidasi caa3 e il percorso dei suoi elettroni · 2YEVRendering miei, fatti con UCSF ChimeraX.
30+anni in ambienti ad alta tecnologia
10.000+ore di raccolta dati ai sincrotroni
60+strutture nel Protein Data Bank
5paesi in cui ho vissuto e lavorato
2900+citazioni dei miei articoli (OpenAlex)

Di cosa mi occupo

Scienza delle linee di luce

Lavoro su I04, una linea di luce di cristallografia macromolecolare di Diamond. Quasi tutti i giorni significa aiutare gli scienziati che vengono a misurare a trasformare una piastra di cristalli minuscoli nei dati migliori possibili, e lasciare la linea un po' migliore per il gruppo successivo.

Biologia strutturale

Dal 1998 ho raccolto dati in più di cinque sincrotroni e ho contribuito a depositare oltre 60 strutture nel Protein Data Bank: metalloproteine, proteine di membrana, proteine virali e qualche sorpresa. In fondo sono un biochimico: voglio sapere cosa fa una proteina e come la sua forma lo spiega.

Strumenti e dati

Mi piace capire lo strumento per intero, dai motori, i rivelatori e l'elettronica fino al software che li comanda. Scrivo codice di acquisizione dati che protegge l'hardware (robot che non si scontrano, mai il fascio diretto sul rivelatore) e che fa dei buoni dati la norma: una linea controllata allo stesso modo ogni giorno e una dose di raggi X su misura per ogni cristallo.

Linux e codice

Linux fa parte della mia vita dagli anni Novanta, quando ho abbandonato una rete Windows a favore di Linux per imparare il livello sottostante: come funzionano davvero i sistemi operativi, le reti e internet. In Australia mi sono innamorato delle macchine virtuali e dei container, e mi piace ancora tantissimo scrivere codice, soprattutto in Python. Tutto questo poggia sul software libero: i buoni strumenti sono migliori se condivisi.

Persone

Alcuni dei momenti di cui vado più fiero sono di altri: un dottorando che finisce la tesi, o un collega che ho formato che passa a un ruolo più alto, anche se alla fine mi fa ombra. Co-supervisiono dottorandi, insegno nei corsi CCP4 e di Diamond, e al lavoro sono addetto al primo soccorso per la salute mentale.

Comunità

Sono stato presidente della Society of Crystallographers in Australia and New Zealand, e sono Fellow della BCA e della Royal Society of Biology. Più vicino a casa, sono consigliere comunale a Didcot. Dire di no non è il mio forte.

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