Portrait de David Aragão

Scientifique de ligne de lumière senior, Diamond Light Source

David Aragão

Cristallographe des protéines et scientifique de l'instrumentation, toujours en quête des meilleures données possibles. J'adore le code et Linux, et j'aime aider les autres à progresser.

Je suis scientifique de ligne de lumière senior à Diamond Light Source, le synchrotron du Royaume-Uni, papa comblé et oncle de toute une bande de neveux et nièces. J'ai passé l'essentiel de ma vie professionnelle entre rayons X et cristaux de protéines. Depuis 2011, je travaille en science des lignes de lumière plutôt que comme chercheur à temps plein : je m'occupe de toute la chaîne qui transforme un cristal en bonnes données, du matériel et de l'électronique au code et aux systèmes Linux qui les pilotent, et des gens qui s'en servent, des scientifiques de passage aux collègues que je forme. Rien de tel qu'un bon casse-tête, surtout quand c'est la science de quelqu'un d'autre qui en sort gagnante.

L'oxydase caa3 et le chemin de ses électrons
La structure du jourL'oxydase caa3 et le chemin de ses électrons · 2YEVMes propres rendus, faits avec UCSF ChimeraX.
30+ans dans des environnements de haute technologie
10 000+heures de collecte de données en synchrotron
60+structures dans la Protein Data Bank
5pays où j'ai vécu et travaillé
2 900+citations de mes articles (OpenAlex)

Ce que je fais

Science des lignes de lumière

Je travaille sur I04, une ligne de lumière de cristallographie macromoléculaire à Diamond. La plupart du temps, ça veut dire aider les scientifiques de passage à transformer une plaque de cristaux minuscules en les meilleures données possibles, et laisser la ligne un peu meilleure pour l'équipe suivante.

Biologie structurale

Depuis 1998, j'ai collecté des données dans plus de cinq synchrotrons et aidé à déposer plus de 60 structures dans la Protein Data Bank : des métalloprotéines, des protéines membranaires, des protéines virales et quelques surprises. Au fond, je suis biochimiste : je veux savoir ce que fait une protéine, et comment sa forme l'explique.

Instruments et données

J'aime comprendre l'instrument en entier, des moteurs, détecteurs et de l'électronique jusqu'au logiciel qui les pilote. J'écris du code d'acquisition de données qui protège le matériel (des robots qui ne se percutent pas, jamais le faisceau direct sur le détecteur) et qui fait des bonnes données la règle : une ligne vérifiée de la même façon chaque jour, et une dose de rayons X taillée sur mesure pour chaque cristal.

Linux et code

Linux fait partie de ma vie depuis les années 90, quand j'ai remplacé un réseau Windows par Linux pour apprendre la couche d'en dessous : comment fonctionnent vraiment les systèmes d'exploitation, les réseaux et Internet. En Australie, je suis tombé sous le charme des machines virtuelles et des conteneurs, et j'adore toujours écrire du code, surtout en Python. Tout ça repose sur le logiciel libre : les bons outils sont meilleurs quand on les partage.

Les gens

Certains de mes plus beaux moments de fierté appartiennent à d'autres : un doctorant qui termine sa thèse, ou un collègue que j'ai formé qui part vers un poste plus élevé, même s'il finit par me faire de l'ombre. Je co-encadre des doctorants, j'enseigne dans des formations de CCP4 et de Diamond, et au travail je suis secouriste en santé mentale.

Engagement

J'ai été président de la Society of Crystallographers in Australia and New Zealand, et je suis Fellow de la BCA et de la Royal Society of Biology. Plus près de chez moi, je suis conseiller municipal élu à Didcot. Dire non, ce n'est pas mon fort.

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