La capside du virus de la maladie du bec et des plumes

La coque d'un virus qui tue les perroquets, dont la perruche à ventre orange, une espèce menacée.

À gauche : la coque de 60 sous-unités (5J36), faite de douze anneaux de cinq sous-unités, une couleur par anneau. À droite, à la même échelle : l'assemblage de 10 sous-unités (5J09), deux de ces anneaux face à face.

Le virus de la maladie du bec et des plumes (BFDV) infecte les perroquets et les cacatoès du monde entier, et menace des espèces en danger comme la perruche à ventre orange, en Australie. Avec le groupe de Jade Forwood à la Charles Sturt University, nous avons résolu des structures de sa protéine de capside : la coque attendue de 60 sous-unités (5J36), la même coque liée à de l’ADN simple brin (5J37), et un surprenant assemblage de 10 sous-unités (5J09) qui semble être une vraie étape du cycle de vie du virus plutôt qu’une bizarrerie de la cristallisation.

Ces cristaux n’étaient pas faciles. Leurs énormes mailles entassent des milliers de réflexions sur chaque image de diffraction, si bien que la collecte sur la ligne microfocus de l’Australian Synchrotron a demandé un petit faisceau, des diaphragmes et de très fines oscillations pour garder les taches séparées. Les structures donnent un point de départ pour concevoir un vaccin. Mon image de la capside a fini dans le magazine Cosmos (article).

Entrée PDB: 5J36 sur PDBe (aussi sur RCSB PDB)
Mise en ligne: 2016-05-04
Résolution: 2.55 Å
Article: Structural insights into the assembly and regulation of distinct viral capsid complexes. (Nat Commun, 2016)
Plus: Détails techniques, liens et densité électronique

Images et vidéo rendues avec UCSF ChimeraX ; la vue 3D est PDBe Mol*.