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Il capside del virus della malattia del becco e delle penne

Il guscio di un virus che uccide i pappagalli, compreso il parrocchetto ventrearancio, a rischio di estinzione.

A sinistra: il guscio di 60 subunità (5J36), costruito da dodici anelli di cinque subunità, un colore per anello. A destra, alla stessa scala: l'assemblaggio di 10 subunità (5J09), due di quegli anelli faccia a faccia.

Il virus della malattia del becco e delle penne (BFDV) infetta pappagalli e cacatua in tutto il mondo, e minaccia specie a rischio come il parrocchetto ventrearancio australiano. Con il gruppo di Jade Forwood alla Charles Sturt University abbiamo risolto strutture della sua proteina del capside: il guscio atteso di 60 subunità (5J36), lo stesso guscio con DNA a singolo filamento legato (5J37), e un sorprendente assemblaggio di 10 subunità (5J09) che sembra essere una vera tappa del ciclo vitale del virus e non una stranezza della cristallizzazione.

Non erano cristalli facili. Le enormi celle elementari ammassano migliaia di riflessi su ogni immagine di diffrazione, quindi la raccolta dati sulla linea microfocus dell’Australian Synchrotron ha richiesto un fascio piccolo, dei diaframmi e oscillazioni molto sottili (fine slicing) per tenere separate le macchie. Le strutture sono un punto di partenza per progettare un vaccino. La mia immagine del capside è finita sulla rivista Cosmos (articolo).

Codice PDB
5J36 su PDBe (anche su RCSB PDB)
Pubblicata
2016-05-04
Risoluzione
2.55 Å
Articolo
Structural insights into the assembly and regulation of distinct viral capsid complexes. (Nat Commun, 2016)
Altro
Dettagli tecnici, link e densità elettronica

Immagini e video realizzati con UCSF ChimeraX; la vista in 3D è PDBe Mol*.

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