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Il trasportatore di alginato AlgE

Il poro che Pseudomonas aeruginosa usa per esportare l'alginato per i suoi biofilm.

Il barile β di AlgE visto dall'alto, colorato dall'inizio (arancione) alla fine (prugna) della catena.

AlgE si trova nella membrana esterna di Pseudomonas aeruginosa, il batterio responsabile di molte infezioni ospedaliere e delle infezioni polmonari nella fibrosi cistica, e fa uscire l’alginato con cui costruisce i biofilm che lo proteggono. Le strutture, da cristalli cresciuti nella fase cubica lipidica nel laboratorio di Martin Caffrey (4AFK, con altre forme cristalline in 4AZL e 4B61), mostrano due cancelli ai lati di un poro selettivo che sembrano aprirsi a turno per lasciar passare l’alginato.

Ho aiutato a raccogliere ed elaborare i dati, a raffinarli e a risolvere la struttura, e sono uno degli autori delle strutture depositate nel PDB. Non sono autore dell’articolo che le descrive, Tan et al., Acta Crystallographica D (2014).

Codice PDB
4AFK su PDBe (anche su RCSB PDB)
Pubblicata
2013-02-06
Risoluzione
1.897 Å
Articolo
A Conformational Landscape for Alginate Secretion Across the Outer Membrane of Pseudomonas Aeruginosa. (Acta Crystallogr.,Sect.D, 2014)
Altro
Dettagli tecnici, link e densità elettronica

Immagini e video realizzati con UCSF ChimeraX; la vista in 3D è PDBe Mol*.

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