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Il citocromo c3 di Desulfovibrio gigas

La prima struttura che ho raffinato e pubblicato, dal batterio scoperto da Jean LeGall.

Il dimero con i suoi otto gruppi eme, quattro per subunità (prugna e rosa), e i loro atomi di ferro (marrone).

Un citocromo c3 dimerico, una piccola proteina con ben quattro gruppi eme, di Desulfovibrio gigas, raffinato a 1,2 Å. Confrontarlo con tutti i citocromi c3 allora noti ha mostrato regioni che restano uguali nonostante sequenze molto diverse, e una molecola d’acqua sepolta che probabilmente passa gli elettroni tra due degli emi (articolo).

Carlos Frazão aveva raccolto i dati all’EMBL di Amburgo nel 1997; io li ho elaborati e raffinati e ho scritto l’articolo da giovane ricercatore nel suo gruppo, prima che diventasse il mio relatore di dottorato. È stata quindi la prima struttura davvero mia, e lega persone che hanno contato molto per me: D. gigas è il batterio che Jean LeGall descrisse per primo nel 1963, e Larry Sieker e Maria Arménia Carrondo sono tra i coautori.

Codice PDB
1GYO su PDBe (anche su RCSB PDB)
Pubblicata
2002-05-24
Risoluzione
1.2 Å
Articolo
Structure of Dimeric Cytochrome C3 from Desulfovibrio Gigas at 1.2 A Resolution (Acta Crystallogr.,Sect.D, 2003)
Altro
Dettagli tecnici, link e densità elettronica

Immagini e video realizzati con UCSF ChimeraX; la vista in 3D è PDBe Mol*.

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